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砧木主要有枳、酸柚和紅桔等，目前枳砧應用最廣泛，可嫁接柑、桔、橙、柚、金柑等。枳種的采集方法有兩種：一是嫩籽采集；二是成熟種子采集。
1、嫩籽采集：一般在7月中旬收集枳果實，堆漚3～5天，然后用木錘用力均勻敲打，打破果皮，將果實放入水桶中去除果皮和果膠，取出種子，將種子及時用竹篩在清水池或水塘清洗干凈，隨后用0.3％高錳酸鉀浸30分鐘。方法如下：先將種子倒入木桶中，占70％體積，再倒入高錳酸鉀水溶液，邊倒邊攪拌，種子浸入藥液時間30分鐘，然后倒掉藥液，用清水漂洗干凈，放置陰涼處晾干，晾干后即可播種。嫩籽不能久貯，否則發芽率極低。
2、成熟種子采集：9月下旬采集成熟枳果實，取種方法及種子消毒參照嫩籽。成熟種子取出后，如來不及播種，可貯藏一段時間，待收割完晚稻后再播種在晚稻田中。種子貯藏：按種子、沙體積比1：4混合均勻，沙宜選用粗沙，含水量5％～10％(用手一捏成團，輕放即散開)，在室內陰涼處，先在底層墊粗沙5cm，然后將混合好的種子和沙放在上面，高35～50cm，上層再蓋5cm厚粗沙，用麻袋或編織袋蓋實，7～10天翻動一次，檢查水分是否過于干燥，若過干應及時補充水分，重新堆貯。
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