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播種前應先行種子消毒和催芽處理，消毒用溫湯浸種或藥劑消毒。浸種方法根據本地常見病害選擇性的進行。
溫湯浸種：將番茄種子在涼水中浸泡10分鐘，然后放于55℃熱水，不斷快速地攪動，使種子受熱均勻，維持水溫均勻浸泡15分鐘。可防治葉霉病、潰瘍病、早疫病。磷酸三鈉浸種：先用清水泡3小時到4小時，再放入10％磷酸三鈉溶液中浸泡20分鐘，撈出洗凈，主要防治病毒病。
消毒后的種子浸泡6-8小時撈出洗凈，在25℃保溫保濕催芽，催芽期間每天用25℃左右的溫水沖洗種子1～2次，一般每畝地用種量為5克。
冬春育苗需要催芽至70％以上露白播種，夏秋育苗直接用消毒后的種子播種。
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