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小麥紋枯病在整個生育期均可發生危害，主要表現為爛芽、死苗、爛莖、枯孕穗、枯白穗和倒伏等癥狀。該病菌主要危害小麥莖基部1~2莖節的葉鞘和莖桿，小麥發芽后，芽鞘受侵染后變褐，隨后爛芽枯死。田間病苗多在3~4片時顯現癥狀，葉鞘病斑邊緣褐色，中部灰色，呈梭形或橢圓形，病株葉色變黃，無新葉抽出而死亡。拔節后癥狀最為典型，侵染葉鞘后，產生云紋狀病斑，逐漸擴大并向基部延伸，基部病斑成梭形，邊緣褐色，中部灰白色至草黃色，節間受害，莖壁失水變軟，造成倒伏。
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