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不少果農常常忽視根部病害的防治，致使果樹的產量受到嚴重影響。據調查，凡是單一施化肥多、土壤黏重板結的果園發病重。
根部主要病害種類：1.圓斑根腐病。危害仁果類、核果類果樹。
2.生理性爛根。排水不良的黏質地，含鹽量過大、地下水位太高的果園易患此病。
3.根鈣病(蘑菇根腐病)。主要危害梨、蘋果、山楂、杏等果樹。
4.白絹病。該病在沙灘地、土壤黏重、排水不良的果園易發生，仁果類、核果類果樹均有發生。
防治措施：1.增施有機肥或使用抗生菌肥及餅肥，如黑帝腐植酸生態有機肥、神夫牌豆粕生物有機肥等，以增強樹勢，提高抗病能力。2.及時排除積水，合理灌概，防止果園土壤過干或過濕。3.切除病根，消毒晾根，換上新土。用速補一硼鉬鎂鋅鈣高濃縮氨基酸肥5倍液涂刷樹干和主枝，連刷2～3次，間隔15天左右。4.病根和土壤藥劑消毒。用立殺菌500倍液灌土壤，防治圓斑根腐病、根鈣病、白絹病。對重病樹用上述藥液灌根。
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