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1.品種的差異。以中晚熟品種發生較重，早中熟品種發生較輕。
2.生育期間的旱、澇災害是造成高秕率的關鍵因素。大豆花莢期降雨量以180毫米為*。在大豆花莢期，澇害比干旱危害更大，尤其是內澇災害，空秕率、倒伏率均高。另外，如果播種期干旱，就推遲播種，使出苗期延后，減少大豆生育期間能量的積累，也會造成大豆空秕粒。而后期如遇低溫，影響大豆灌漿速度，同樣會造成較高的空秕率。
3.土壤缺硼和鉬是形成高空秕率的另一主要原因。硼和鉬是大豆發育必需的微量元素，與莢果形成關系密切。如土壤耕作層硼和鉬的含量低，種植大豆時不追肥，勢必增加大豆的空秕率。特別是重茬種植大豆，單株空秕率逐年增加。目前還存在施肥深度淺，種肥同床、同位，肥料利用率低等現象，影響大豆產量的提高。
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