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種菇后的廢料含有較多的病菌,一般不要施在棉花、西瓜田內,以免病害加重,但可以施在小麥、玉米、大豆等糧食作物田中。種菇時,為了調節菌料的酸堿度,一般都使用石灰水。但菇在生長過程中,對石灰水中鈣離子吸收較少,因此在鹽堿地中盡量少施,以避免堿性增加。由于種菇后的廢料中含有較多的鈣離子,而這些鈣離子易和磷肥中的有效成分結合,形成不易被作物吸收的磷酸鈣,造成磷的固定,使肥效降低。因此,種菇后的廢料不能和磷肥混用。為了殺滅栽培料中的雜菌,常使用一些殺菌刑。由于這些殺菌劑在棉籽皮中有一定的殘留,使用時不要和菌肥混合使用,以免降低菌肥的作用。
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