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　　番茄畸形果也稱變形果，各地均有發生，尤以保護地番茄發生較多。生產上常見到的畸形果有縱溝果、扁圓果、橢圓果、偏心果、指突果、桃形果、豆形果、菊形果、亂形果，以及其他奇形怪狀的果實。

　　番茄畸形果的發生主要是由于環境條件不適宜造成的。其中，扁圓果、橢圓果、偏心果、雙（多）圓心果等畸形果發生的直接原因是在花芽分化及花芽發育時，營養土中化肥過多，造成土壤中速效養分含量過高，根系吸收的大量養分積累在生長點處，肥水過于充足，超過了花芽正常分化與發育的需要量，致使花器畸形，番茄心室數量增多，而生長又不整齊，從而產生上述畸形果。如遇上低溫，即夜溫低于8℃、白天溫度低于20℃時，且地溫低，呼吸消耗少時，也易使花器畸形，更會加重病情。此外，施用磷肥過量或缺鈣、硼時也易出現上述畸形果。

　　指突果是在子房發育初期，由于營養物質分配失去平衡，而促使正常心皮分化出獨立的心皮原基而產生的。多發生在氮肥多和夜溫低的條件下。

　　桃形果是由于植株老化，營養物質生產不足導致形成的心室減少，子房畸形發育而成。使用2，4-D等植物生長調節劑蘸花、噴花時，濃度過高，會加劇病情，增多桃形果數量和嚴重程度。

　　營養條件差、本來要落掉的花雖經蘸花、噴花處理抑制了離層形成，勉強坐住了果，但因得到光合產物少，長不起來或停止生長，就形成了豆形果或酸漿果。

　　菊形果系心室數目多，施用氮、磷肥過量或缺鈣、缺硼時易產生。遇低溫會加重病情。