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果實臍腐病是指近花柱的一端（臍部）先變為黑褐色，然后腐爛的現象。這種現象，在高溫干旱季節較為常見。番茄果實的臍腐發生原因是由于果實中缺鈣引起。由于鈣的不足，引起果實臍部組織的崩潰。另外因土壤干燥，水分不足，引起的臍腐病是一種生理病害。
克服臍腐病的發生一是多施有機肥料，增加土壤保水力。二是施鈣鹽，增加果實中的含鈣量。番茄結果后1個月內，是吸收鈣的關鍵時期。可噴灑1％的過磷酸鈣，或0.5％氯化鈣加5mg／kg萘乙酸、0.1％硝酸鈣及愛多收6000倍液，或綠芬威3號1000--1500倍液。從初花期開始，隔10—15天1次，連續噴灑2--3次。使用氯化鈣及硝酸鈣時，不可與含硫的農藥及磷酸鹽(如磷酸二氫鉀)混用。三是選用抗病品種。四是澆足定植水，保證花期及結果初期有足夠的水分供應，在果實膨大后，應注意適當給水。
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