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番茄育苗播種前，對種子進行必要的消毒處理，是防病增產的重要措施。
1.溫湯浸種：(1)先將種子放入50℃的溫水中浸泡25分鐘，再放入涼水中冷卻，然后催芽播種，可以預防番茄斑枯病和枯萎病；(2)先將種子放入52℃的溫水中浸泡30分鐘，再放入涼水中冷卻，可以預防早疫病、葉霉病和潰瘍病；(3)先將種子放入55℃溫水中浸泡10分鐘，再放入涼水中冷卻，然后催芽播種，可以預防番茄黑斑病。
2.藥劑拌種：用50%克菌可濕性粉劑按種子量的0.3～0.5%拌種，可以預防番茄枯萎病。
3.藥液浸種：(1)先將種子用清水預浸3～4小時，再放入10%磷酸三鈉溶液中浸泡20～30分鐘；或者將種子先用肥皂水反復搓洗，再放入0.1%高錳酸鉀溶液中浸泡10～15分鐘，撈出用清水洗凈后催芽播種，可除去附著在種子表面的花葉病毒；(2)先將種子用清水預浸3小時，再用100倍福爾馬林溶液浸泡20分鐘，撈出洗凈后催芽播種，可以預防番茄早疫病；(3)先將種子用冷水預浸6～15小時，再移入1%硫酸銅溶液浸種5分鐘，撈出洗凈后催芽播種，可以預防番茄黑斑病。
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