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選背風向陽、地勢略高、地下水位較低的地方挖窖，窖的大小按貯種量、地勢、土質而定，一般2.5立方米的窖可貯存250公斤的稻種。窖深以1.5—2米為宜，如挖窖過深，窖內濕度容易增大，使種子的含水量增加。窖的大小以2立方米左右為宜，土質好的也不宜超過3立方米。長形窖比圓形窖好，容易控制溫度，不致窖溫過高而壞種。
稻種入窖時間以土層上凍3—6厘米厚時為好，出窖時間以土層化凍6—10厘米厚時為好。過早出窖，氣溫尚不穩定，一凍一化，易降低稻種的發芽率;過晚出窖，稻種易受潮，降低其生活力。出窖后的稻種應蓋苫防寒，切忌立即曬種，以免種子破皮，降低其發芽率。出窖后先將稻種置于通風的地方，風干后再行曬種。
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